Logistiikan tutkimuksessa keskitymme erityisesti kuljetuksiin ja kuljetusjärjestelmään. Korostuvina näkökulmina ovat kestävyys, citylogistiikka, tehokkuus ja toiminnan jatkuvuus (resilienssi). Tähän tutkimusteemaan liittyy esimerkiksi älykkään sähköisen kaupunkilogistiikan SeCLog-hanke. Vernessä on myös tehty selvityksiä Huoltovarmuuskeskukselle, etenkin ilmakuljetusten huoltovarmuuteen liittyen.